Klipper はkdebaseパッケージとともにコンパイル及びインストールされなければなりません。すると、KDE 2を起動するとKDEパネル(Kicker)上にKlipper が現れるでしょう。
これがお望みではないのなら、$KDEDIR/bin/startkdeファイル内のKlipper への参照を削除して下さい。